肠道、口腔、皮肤、阴道是人体四大菌库，现在研究得最多的是肠道及阴道的微生态，肠道是人体内最大的菌库。

存在于消化系统中的细菌数量是如此庞大，有人曾统计，肠道内有多达400多种约10万亿个细菌，重达2公斤。食道中的细菌就有103—106个/克，小肠 中有103—106个/克，到大肠或结肠中则增加到108—1011个/克，而粪便湿重的10—30%都含有细菌.

实际上你肠道中的细菌总数比你身体里的细胞总数还多。在健康肠道中，正常情况下，对人体有益的细菌与有害菌的比例为10：1。肠道中庞大的菌群之间相互依存、相互制约，正常情况下，这个系统处于动态平衡状态，维护人体的健康。