益生元主要包括各种寡糖类物质（Oligosaccharides）或称低聚糖（由2～10个分子单糖组成）。一般可以认为，益生元给益生菌提供“食物”,能够被肠道内有益细菌分解吸收，促进有益细菌生长繁殖。异麦芽低聚糖和低聚果糖是益生元中最为优异的代表。

池根亿益生菌本身除了益生菌制剂和复合矿物质维生素以外，还添加有优异的益生元——低聚果糖和低聚半乳糖，可以有效调节肠道微生态，所以不需要额外搭配益生元。